El Programa de Estímulos al Desempeño del Personal Docente tiene por objetivos generales:

• a) Estimular el desempeño sobresaliente del personal académico ordinario de carrera de tiempo completo con categoría de asociado o titular de la UABCS integrado en cuerpos académicos, con el objeto de mejorar la calidad de la docencia, la generación y aplicación del conocimiento, la difusión y la extensión, los servicios eficientes y oportuno de atención al alumnado y la gestión Académica. Lo anterior para incidir en la preparación de personal profesional competitivo, con una formación integral y con espíritu humanista, que contribuya al desarrollo social y al aprovechamiento sustentable los recursos marinos y terrestres en Baja California Sur.
• b) Reafirmar la trascendencia del papel del personal académico ordinario de carrera de tiempo completo con categoría de asociado o titular, que, con su preparación, dedicación, habilitación y responsabilidad en sus tareas de docencia, generación y aplicación del conocimiento, extensión y difusión de la cultura, colabora para que la Universidad ofrezca programas académicos pertinentes y acreditados, y servicios de gestión certificados.
• c) Reconocer al personal académico que se dedica en forma exclusiva y profesional a trabajar para la UABCS, contribuyendo a mejorar la calidad en la formación integral de las y los profesionistas, con énfasis en la superación intelectual y el fomento de los valores humanísticos en el alumnado.
• d) Alentar la Generación y Aplicación del Conocimiento que se oriente a fortalecer los PE y que el personal académico mejor preparado y con mayor grado académico coadyuven con mayor énfasis a la formación de las y los nuevos profesionales que contribuyan al desarrollo económico, social y cultural de la región.
• e) Extender y arraigar en el seno de la institución una cultura de evaluación, como una práctica permanente e indispensable para la superación y mejoramiento del trabajo académico.

• f) Fortalecer en el personal académico el ejercicio de la docencia centrada en el aprendizaje del alumnado, donde cada persona es responsable de construir su propio conocimiento con base principalmente en experiencias.